杨广北巡雁门被围，侥幸脱身之后，竟丢下关中，径直前往江南行宫，再无北归之意。昔日那位曾三征高句丽、意气风发的雄主，如今仿佛被抽干了魂魄，龟缩在江南的宫苑深处，终日与酒色为伴，对天下纷乱不闻不问。
曾经辉煌的大隋王朝，此刻正如大厦将倾，风雨飘摇。终南山中的风，似乎也比往年都要凛冽几分，漫山遍野的红枫，在萧瑟的秋风中簌簌颤抖，枯叶打着旋儿落下，恰似这摇摇欲坠的江山，每一片叶子的坠落，都像是敲在人心上的丧钟。
变故来得猝不及防。一日小云下山采买归来，面色惨白，浑身尘土，一进茅庐便跪地叩首：“公子，师父，山外乱了！听说……听说李渊以“尊隋讨贼“为民起兵，在儿子李建成，李世民，李元吉和女儿李秀宁的帮助下，一路招降纳叛，并联合关陇士族马上就要进攻长安，天下彻底乱了，各州各县都在打仗，流民遍地，还有盗匪烧杀抢掠，惨不忍睹！”
茅庐之中，瞬间陷入寂静。孙思邈缓缓放下手中捣药的玉杵，抚须长叹。他那双阅尽人间沧桑的眼眸中，此刻满是深深的忧思与疲惫。他行医一生，踏遍山河，见过太多的生老病死，却最怕这乱世纷争。医者能治病，却医不了国运；能救一人之性命，却救不了万民于水火。他最担心的，是这天下大乱之后，必将是瘟疫横行，到时候百姓流离失所，无医无药，只能在痛苦与绝望中煎熬而死。
李玉心中更是翻涌不已，他今年不过十岁，虽在山中待了三年，却日日思念春风楼的娘亲，思念那些待他如已出的姨娘们。每个月他都会托下山采购的货郎给城中的母亲捎去书信和物资。母亲总是回信说“一切安好”，让他安心学艺，莫要挂念。
如今，李渊大军兵临城下的消息传来，长安城恐怕早已是人心惶惶。李玉的心瞬间被撕扯成了两半，那是深入骨髓的担忧——不知她们是否安好？春风楼那样的地方，虽然繁华，但在战火面前，恐怕脆弱得如同纸糊一般，是否也已遭了战火波及？
这三年李玉随孙思邈踏遍深山识百草，辨得千种药性；守在茅庐诊病患，学得切脉、开方、针灸之术，更将现代医学的消毒、护理之法，悄悄融入师父的诊疗之中——除了师徒合力炼出的酒精，青霉素，他还指点师父用煮沸的草木灰水清洗器具，教病患伤口保持干燥，救下了无数因感染而濒危的伤者。
孙思邈对这个徒弟愈发偏爱，不仅倾囊相授毕生所学，更常与他彻夜长谈医道、世事。他知李玉心中藏着无尽的见识，也懂这孩子看似沉静
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