世民下定决心，整军经武、强兵备战，全面提升唐军士卒的战斗力。他亲自抓起军事训练，每日召集数百名禁军精锐，在显德殿前的广场上教习骑射之术，摒弃朝堂繁文缛节，亲自坐镇现场考核士卒武艺，凡箭术精准、武艺出众者，当即赏赐弓刀、布匹绸缎，予以重奖激励。在皇帝的亲自督导之下，唐军将士无不刻苦操练、奋勇争先，短短数月之间，原本疲弱的禁军便脱胎换骨，“士卒皆为精锐”，成为大唐最坚实的武力屏障。
除了日常练兵，李世民更从根本制度上整顿军制，对沿袭而来的府兵制度进行全面改革，将天下各地的军府统一更名为折冲府，完善府兵的征调、训练、驻防体系，实现“兵农合一、战时为兵、闲时为农”，既不耽误民生耕种，又能储备充足兵源。此次改制之后，天下共设立军府六百三十四所，其中仅关中腹地便设置军府二百六十一所，占据天下军府近半数，形成“举关中之众以临四方”的战略格局——以京师所在的关中为核心，掌控天下最精锐的府兵，对内可震慑四方、稳定政局，对外可抵御强敌、出征边塞，从制度上筑牢了大唐的军事根基，为日后扫平突厥、经略西域埋下了至关重要的伏笔。
内修军政、外退强敌之后，李世民开始稳步梳理朝纲、规范礼制、定立储君，一步步稳固大唐江山。九月初一，退走草原的颉利可汗，为示修好之意，特意派遣使者向大唐进献良马三千匹、牛羊一万口，以此赔罪求和。李世民却断然拒绝了这份献礼，他当即告知突厥使者，金银牲畜皆非大唐所求，只下令颉利可汗，必须将此次入侵途中掳掠走的大唐百姓，尽数放归中原、归还故里。这一举措，远比收纳牛羊马匹更得民心，既彰显了大唐天子以民为本的本心，也维护了中原王朝的尊严，让突厥再不敢轻视大唐。
九月二十七日，李世民为端正民风、杜绝妖妄、规范礼法，正式颁布诏令，严禁天下私人之家擅自设立妖神祠庙、随意举办不合礼制的祭祀活动，凡不合朝廷礼法、装神弄鬼的祭祀祈祷，一律全面禁绝；同时规范占卜之术，除了龟甲、兽骨占卜等正统五卜之法外，其余旁门左道、蛊惑人心的杂卜卦术，全部停止使用、严厉禁止。这道旨意，肃清了民间虚妄之风，确立了正统礼法秩序，让天下民风归于淳正。
皇权稳固、朝政有序之后，立储之事便提上日程。十一月初八，李世民正式颁诏，册立中山王李承乾为皇太子，定下皇统传承，彻底杜绝了日后皇位之争的隐患，让大唐国本得以稳固。
在此之前的十一月初五，李世民为革除
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